引用本文: 明德松, 鄧勇. 我國銅綠假單胞菌耐氨基糖苷類基因分布的文獻研究. 中國循證醫學雜志, 2014, 14(7): 874-877. doi: 10.7507/1672-2531.20140144 復制
近年來,銅綠假單胞菌對氨基糖苷類抗生素的耐藥率不斷上升。其耐藥主要機制有產生氨基糖苷類修飾酶、細菌16S rRNA基因甲基化酶和氨基糖苷類抗菌藥物作用靶位16S rRNA基因突變[1-3]。為了解我國銅綠假單胞菌對氨基糖苷類的相關耐藥機制及我國南北地區耐藥機制的差異[1-27],筆者對近年來我國關于銅綠假單胞菌耐氨基糖苷類藥物機制的相關文獻進行了系統評價。
1 資料與方法
1.1 納入與排除標準
納入標準:報道我國銅綠假單胞菌耐氨基糖苷類基因的相關研究。耐喹諾酮類藥物的銅綠假單胞菌為經臨床藥敏試驗發現,其耐氨基糖苷類基因通過PCR檢測。
排除標準:①菌株來源于多個地區且各地區菌株數數據欠詳細;②檢測多個耐藥基因但耐藥基因分布數據不明的研究。
1.2 檢索策略
計算機檢索CBM、CNKI、VIP和WanFang Data數據庫,收集關于銅綠假單胞菌耐氨基糖苷藥物的相關文獻,檢索時限均從建庫至2012年12月。英文檢索詞包括pseudomonas aeruginosa、aminoglycoside、amikacin和gentamicin;中文檢索詞包括銅綠假單孢桿菌、氨基糖苷類、阿米卡星和慶大霉素。以CNKI為例,其具體檢索策略見框1。
框?1?CNKI檢索策略
#1 ?銅綠假單胞菌 #2 ?氨基糖苷類 #3 ?阿米卡星OR慶大霉素 #4 ?#1 AND #2 OR #3
1.3 文獻篩選與資料提取
由2名研究員根據納入與排除標準獨立進行文獻篩選、資料提取,如遇分歧,討論解決。資料提取主要包括:作者、年份、菌株數量、耐藥基因等。
1.4 統計分析
統計分析采用SPSS 17.0軟件,率的比較采用χ2檢驗,檢驗水準為α=0.05。
2 結果
2.1 文獻檢索結果
初檢出有關銅綠假單胞菌耐氨基糖苷類基因的文獻172篇,后經過逐層篩選,最終納入27篇[1-27],累計報道我國10個省市的共1 144株耐氨基糖苷類銅綠假單胞菌。其中,淮河以北地區(北京、天津、山東、江蘇)共702株,淮河以南地區(浙江、上海、安徽、福建、湖南、廣東)共442株。文獻篩選流程及結果見圖 1,納入菌株基因突變情況見表 1。


2.2 氨基糖苷類修飾酶(aminoglycosides modification enzymes,AMEs)耐藥基因檢測結果
如表 1和表 2所示,AMEs耐藥基因aac(3’)-Ⅰ、aac(3’)-Ⅱ、aac(6’)-Ⅰ、ant(2’’)-Ⅰ在淮河以北地區的檢出率高于淮河以南地區(P < 0.05),而aac(6’)-Ⅱ、ant(3’’)-Ⅰ、aph(3’)-Ⅵ的檢出率淮河以北和淮河以南地區差異無統計學意義(P>0.05)。淮河以北地區基因aac(3’)-Ⅱ、aac(6’)-Ⅱ、ant(2’’)-Ⅰ檢出率最高,淮河以南地區基因aac(6’)-Ⅱ最高,其次是基因ant(2’’)-Ⅰ、ant(3’’)-Ⅰ。

2.3 16S rRNA甲基化酶基因分布
16S rRNA基因甲基化酶基因主要有armA、rmtA、rmtB、rmtC、rmtD、rmtE。本文共納入5篇文獻,以淮河以南地區為主(表 3)。其中rmtA基因檢出率最高達20.4%;其次是rmtB基因(19.4%)和armA基因(0.7%)。rmtA基因與rmtB基因檢出率相比,差異無統計學意義(P=0.84),但均明顯高于armA基因的檢出率(P均 < 0.05)。

3 討論
銅綠假單胞菌耐氨基糖苷類藥物的主要機制有AMEs的產生、細菌16S rRNA基因甲基化酶和氨基糖苷類抗菌藥物作用靶位16S rRNA基因突變等。AMEs基因主要有aac(3’)-Ⅰ、aac(3’)-Ⅱ、aac(6’)-Ⅰ、aac(6’)-Ⅱ、ant(2’’)-Ⅰ、ant(3’’)-Ⅰ、aph(3’)-Ⅵ共7種;細菌16S rRNA甲基化酶主要基因有armA、rmtA、rmtB、rmtC、rmtD、rmtE共6種。
本研究對我國銅綠假單胞菌耐氨基糖苷類耐藥基因的分布情況進行分析,結果顯示我國以AMEs基因aac(3’)-Ⅱ、aac(6’)-Ⅱ、ant(2’’)-Ⅰ的檢出率最高。淮河以北地區AMEs基因普遍高于淮南地區,其中基因aac(3’)-Ⅰ、aac(3’)-Ⅱ、aac(6’)-Ⅰ、ant(2’’)-Ⅰ的檢出率明顯高于淮河以南地區。淮河以北地區耐氨基糖苷類銅綠假單胞菌AMEs基因主要以ant(2’’)-Ⅰ、aac(3’)-Ⅱ、aac(6’)-Ⅱ為主,而淮河以南地區則以aac(6’)-Ⅱ、ant(2’’)-Ⅰ、ant(3’’)-Ⅰ等為主。
16S rRNA甲基化酶基因在我國銅綠假單胞菌中的檢出率相對較低,但其是導致銅綠假單胞菌耐氨基糖苷類藥物的另一重要因素。本研究發現我國只檢測出了甲基化酶基因armA、rmtA、rmtB,而rmtC、rmtD、rmtE基因尚未見檢出。
耐氨基糖苷類藥物銅綠假單胞菌存在多重耐藥基因共存的問題,這將導致該細菌對氨基糖苷類藥物高度耐藥,給臨床治療帶來很大困難,值得臨床重視。
綜上所述,在我國耐氨基糖苷類藥物的銅綠假單胞菌的耐藥基因以AMEs基因為主,其次是16S rRNA甲基化酶基因。
近年來,銅綠假單胞菌對氨基糖苷類抗生素的耐藥率不斷上升。其耐藥主要機制有產生氨基糖苷類修飾酶、細菌16S rRNA基因甲基化酶和氨基糖苷類抗菌藥物作用靶位16S rRNA基因突變[1-3]。為了解我國銅綠假單胞菌對氨基糖苷類的相關耐藥機制及我國南北地區耐藥機制的差異[1-27],筆者對近年來我國關于銅綠假單胞菌耐氨基糖苷類藥物機制的相關文獻進行了系統評價。
1 資料與方法
1.1 納入與排除標準
納入標準:報道我國銅綠假單胞菌耐氨基糖苷類基因的相關研究。耐喹諾酮類藥物的銅綠假單胞菌為經臨床藥敏試驗發現,其耐氨基糖苷類基因通過PCR檢測。
排除標準:①菌株來源于多個地區且各地區菌株數數據欠詳細;②檢測多個耐藥基因但耐藥基因分布數據不明的研究。
1.2 檢索策略
計算機檢索CBM、CNKI、VIP和WanFang Data數據庫,收集關于銅綠假單胞菌耐氨基糖苷藥物的相關文獻,檢索時限均從建庫至2012年12月。英文檢索詞包括pseudomonas aeruginosa、aminoglycoside、amikacin和gentamicin;中文檢索詞包括銅綠假單孢桿菌、氨基糖苷類、阿米卡星和慶大霉素。以CNKI為例,其具體檢索策略見框1。
框?1?CNKI檢索策略
#1 ?銅綠假單胞菌 #2 ?氨基糖苷類 #3 ?阿米卡星OR慶大霉素 #4 ?#1 AND #2 OR #3
1.3 文獻篩選與資料提取
由2名研究員根據納入與排除標準獨立進行文獻篩選、資料提取,如遇分歧,討論解決。資料提取主要包括:作者、年份、菌株數量、耐藥基因等。
1.4 統計分析
統計分析采用SPSS 17.0軟件,率的比較采用χ2檢驗,檢驗水準為α=0.05。
2 結果
2.1 文獻檢索結果
初檢出有關銅綠假單胞菌耐氨基糖苷類基因的文獻172篇,后經過逐層篩選,最終納入27篇[1-27],累計報道我國10個省市的共1 144株耐氨基糖苷類銅綠假單胞菌。其中,淮河以北地區(北京、天津、山東、江蘇)共702株,淮河以南地區(浙江、上海、安徽、福建、湖南、廣東)共442株。文獻篩選流程及結果見圖 1,納入菌株基因突變情況見表 1。


2.2 氨基糖苷類修飾酶(aminoglycosides modification enzymes,AMEs)耐藥基因檢測結果
如表 1和表 2所示,AMEs耐藥基因aac(3’)-Ⅰ、aac(3’)-Ⅱ、aac(6’)-Ⅰ、ant(2’’)-Ⅰ在淮河以北地區的檢出率高于淮河以南地區(P < 0.05),而aac(6’)-Ⅱ、ant(3’’)-Ⅰ、aph(3’)-Ⅵ的檢出率淮河以北和淮河以南地區差異無統計學意義(P>0.05)。淮河以北地區基因aac(3’)-Ⅱ、aac(6’)-Ⅱ、ant(2’’)-Ⅰ檢出率最高,淮河以南地區基因aac(6’)-Ⅱ最高,其次是基因ant(2’’)-Ⅰ、ant(3’’)-Ⅰ。

2.3 16S rRNA甲基化酶基因分布
16S rRNA基因甲基化酶基因主要有armA、rmtA、rmtB、rmtC、rmtD、rmtE。本文共納入5篇文獻,以淮河以南地區為主(表 3)。其中rmtA基因檢出率最高達20.4%;其次是rmtB基因(19.4%)和armA基因(0.7%)。rmtA基因與rmtB基因檢出率相比,差異無統計學意義(P=0.84),但均明顯高于armA基因的檢出率(P均 < 0.05)。

3 討論
銅綠假單胞菌耐氨基糖苷類藥物的主要機制有AMEs的產生、細菌16S rRNA基因甲基化酶和氨基糖苷類抗菌藥物作用靶位16S rRNA基因突變等。AMEs基因主要有aac(3’)-Ⅰ、aac(3’)-Ⅱ、aac(6’)-Ⅰ、aac(6’)-Ⅱ、ant(2’’)-Ⅰ、ant(3’’)-Ⅰ、aph(3’)-Ⅵ共7種;細菌16S rRNA甲基化酶主要基因有armA、rmtA、rmtB、rmtC、rmtD、rmtE共6種。
本研究對我國銅綠假單胞菌耐氨基糖苷類耐藥基因的分布情況進行分析,結果顯示我國以AMEs基因aac(3’)-Ⅱ、aac(6’)-Ⅱ、ant(2’’)-Ⅰ的檢出率最高。淮河以北地區AMEs基因普遍高于淮南地區,其中基因aac(3’)-Ⅰ、aac(3’)-Ⅱ、aac(6’)-Ⅰ、ant(2’’)-Ⅰ的檢出率明顯高于淮河以南地區。淮河以北地區耐氨基糖苷類銅綠假單胞菌AMEs基因主要以ant(2’’)-Ⅰ、aac(3’)-Ⅱ、aac(6’)-Ⅱ為主,而淮河以南地區則以aac(6’)-Ⅱ、ant(2’’)-Ⅰ、ant(3’’)-Ⅰ等為主。
16S rRNA甲基化酶基因在我國銅綠假單胞菌中的檢出率相對較低,但其是導致銅綠假單胞菌耐氨基糖苷類藥物的另一重要因素。本研究發現我國只檢測出了甲基化酶基因armA、rmtA、rmtB,而rmtC、rmtD、rmtE基因尚未見檢出。
耐氨基糖苷類藥物銅綠假單胞菌存在多重耐藥基因共存的問題,這將導致該細菌對氨基糖苷類藥物高度耐藥,給臨床治療帶來很大困難,值得臨床重視。
綜上所述,在我國耐氨基糖苷類藥物的銅綠假單胞菌的耐藥基因以AMEs基因為主,其次是16S rRNA甲基化酶基因。