目的探討二代測序（NGS）技術在耶氏肺孢子菌肺炎（PCP）診斷方面的價值。方法對 2 例肺移植后 PCP 患者的痰液和肺泡灌洗液行 NGS 檢測，發現耶氏肺孢子菌感染，報告此 2 例患者的臨床資料、影像學特點、實驗室檢查和治療情況，并在 PubMed 上以關鍵詞“肺移植/實體器官移植”和“耶氏肺孢子菌”搜索并文獻復習。結果以關鍵詞“肺移植/實體器官移植”和“耶氏肺孢子菌”搜索共檢索到 6 篇相關文獻，其中病例報道 3 篇，共有 66 例肺移植患者合并耶氏肺孢子菌感染。PCP 臨床多表現為發熱、不同程度呼吸困難，影像學可顯示彌漫“磨玻璃”浸潤影，CT 是檢測 PCP 的敏感手段；聯合免疫熒光鏡檢/聚合酶鏈反應/血清 1,3-β-D-葡聚糖可有效提高微生物檢測準確率；此外，NGS 可快速、精確地確定致病菌，指導針對性治療，改善預后。復方磺胺甲基異噁唑（TMP/SMZ）為治療首選藥物，對于免疫抑制患者建議長期小劑量預防。結論PCP 好發于器官移植后免疫抑制的患者，NGS 可幫助快速精確診斷，TMP/SMZ 為治療首選藥物，治療應早期足量。