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        華西醫學期刊出版社
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        找到 作者 包含"孟晨曦" 1條結果
        • 環狀RNA在癲癇患者外周血單個核細胞中的表達分析及生物信息學預測

          目的 研究4種環狀RNA(circular RNA,circRNA)在癲癇患者外周血單個核細胞(Peripheral blood mononuclear cell,PBMC)中的表達及運用生物信息學進行功能預測,為癲癇的發病機制探究提供依據。方法 選取2020年5月—2021年5月于內蒙古科技大學包頭醫學院第一附屬醫院神經內科診治的癲癇患者22例,其中男13例、女8例,平均年齡(36.41±8.39)歲;健康對照組22名,男、女各11名,平均年齡(34.41±8.68)歲。采用實時熒光定量PCR法檢測PBMC中的circRNA: EFCAB2、C14orf159、PARG、TMEM39的表達水平并利用生物信息學對其功能進行預測。結果 相比對照組,EFCAB2和C14orf159兩種circRNA在癲癇患者外周血PBMC中明顯升高,EFCAB2相對表達為1.42±0.06(t=29.41),C14orf159相對表達為1.31±0.03(t=25.27),PARG、TMEM39在外周血PBMC中未檢測到。生物信息學分析顯示EFCAB2得到的三個微小RNA(micro RNA, miRNA):miR-6873-3p、miR-6739-3p、miR-7110-3p;C14orf159得到的三個miRNA:miR-1180-3p、miR-6501-3p、miR-3622b-5p。通過TargetScan數據庫對癲癇相關的基因進行預測,EFCAB2:miR-6873-3p符合條件的共有11個下游基因;miR-6739-3p符合條件的共有7個下游基因;miR-7110-3p符合條件的共有14個下游基因。C14orf159:miR-6501-3p符合條件的共有9個下游基因;miR-3622b-5p符合條件的共有14個下游基因;miR-1180-3p符合條件的共個1下游基因。結論 研究表明EFCAB2和C14orf159兩種circRNA可能是癲癇的重要生物學標志物,通過生物信息學分析,這兩種circRNA可能具備充當“分子海綿”調控癲癇。EFCAB2具備充當miR-6873-3p和miR-7110-3p“分子海綿”的潛能,同時發現miR-6873-3p和miR-7110-3擁有共同的下游靶基因MAP1B-通過調控電壓門控鈉通道在癲癇中發揮作用;C14orf159可以充當miR-6501-3p 的分子海綿從而調控CCL3的表達在癲癇中發揮作用。

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